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Gelfree 8100 多通道蛋白质分组系统
随着生物质谱技术的快速发展,蛋白质和多肽分析的分辨率、灵敏度、准确性、鉴定能力大为提高。尤其是Top-down蛋白质鉴定方法大量使用后,传统的一维、二维电泳或液相色谱等样品制备技术已经不能满足需要。分析前如何降低样品的复杂程度、获得完整蛋白质、富集低丰度蛋白质、降低高丰度蛋白质对低丰度蛋白质的干扰、保留蛋白质的各种翻译后修饰状态、提高样品处理通量等,已成为蛋白质样品制备方法的重要前提。
美国Protein Discovery公司(现已被英国Expedeon公司收购)推出了一套新颖的蛋白质分组系统—Gelfree 8100。该系统使用凝胶洗脱液相组分截留电泳技术(gel-eluted liquid fraction entrapment electrophoresis,GELFrEE),基于蛋白质分子量的不同,对完整蛋白质进行分组,使用移液器在液相中回收蛋白质。该系统能在短时间内同时处理8个样品。在3.5kDa—500kDa范围内,相对于其它传统分组方法,具有上样量大、重现性好、分辨率高、回收率高、分离速度快和操作简单的优点。能增大蛋白质组分析的覆盖范围,改善后期质谱分析的结果,提高蛋白质鉴定结果的可信度。
Gelfree 8100蛋白质分组系统由主机和8通道电泳槽两部分构成。主机设计紧凑,能为8个独立的电泳通道提供电压。使用触摸屏,可以设置电压、分组数和使用的通道数等参数。运行过程中,触摸屏实时显示每个通道电泳状态及电压电流值。电泳槽由五个部分组成,分别是:阴极缓冲液槽、上样槽、电泳凝胶管、样品收集槽、阳极缓冲液槽。电泳凝胶管是内装预制SDS-PAGE胶的玻璃管。缓冲液槽与上样槽及收集槽之间由一个截留分子量为3.5kDa的膜分隔开。
Gelfree 8100蛋白质分组系统的工作原理:
样品和样品缓冲液混合后加入到上样槽内。
电泳开始后,蛋白质首先在浓缩胶内浓缩。
蛋白质进入分离胶之前被浓缩成一条窄带。
在分离胶内,较小的蛋白质移动更快,更先从胶内进入收集槽。
到达预设的收集时间时,电泳暂停,从收集槽中收集第一组分的蛋白质。
继续电泳,重复收集操作,直至完成所有组分的收集。
使用Gelfree 8100(胶浓度为10%)将200微克酿酒酵母菌总蛋白分离成12个组分,然后使用一维蛋白质电泳观察分组结果。
选取来自不同通道的三个分组,使用一维蛋白质电泳观察分组结果的重现性。
对于不同的蛋白质上样量,优化好收集间隔时间,可以最大程度的提高蛋白质的回收效率。
Gelfree 8100蛋白质分组系统的特点: l
● 基于分子量的不同对完整蛋白质进行分离;
● 简化蛋白质组成的复杂程度,缩小复杂蛋白质样品的动态范围,便于使用LC-MS/MS进行Bottom-Up蛋白质组学研究;
● 蛋白质回收后保留其完整性,便于进行Top-Down蛋白质组学研究,分析翻译后修饰、蛋白质异构体、氨基酸衍生物等;
● 蛋白质分离范围高达3.5kDa—500kDa;
● 8个分组通道,满足高通量样品处理的要求,每个通道最多可将样品分为30个组分;
● 用户可根据需要自行设置蛋白质分组程序,分离纯化特定的目标蛋白;
● 样品容量大,每个通道蛋白质上样量最高可达1mg,是普通一维电泳的5倍以上,有利于富集低丰度蛋白质;
● 样品回收率高,>80%;
● 结果高度的重现性,CV<15%;
● 电泳过程不受蛋白质疏水性或等电点的影响;
● 蛋白质样品在液相中回收,避免了传统一维、二维电泳后的染色和条带或点位切割步骤;
● 蛋白质回收后在溶液内消化,免去了费时的胶内消化步骤; ● 特别适合为LC-MS/MS、MALDI-TOF或免疫印迹等分析方法制备样品; l
Gelfree 8100蛋白质分组系统和质谱结合时,制备蛋白质样品的操作流程
电泳槽: 一次性电泳槽包含8个独立通道,可同时使用1—8个通道,处理1—8个样品,未使用的通道可保存供以后使用。针对不同的需求,提供四种凝胶盒供选择。
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